Pour sauver sa mère, Angeline Fowl, d'une maladie magique, Artemis doit remonter le cours du temps pour retrouver le lémurien qui possède l'antidote. Avec l'aide de la fée Holly Short, il repart dans la passé mais se heurte à la fée Opale Koboi, et à lui-même alors qu'il est âgé de 10 ans.