Sur Dune, la planète des sables, les anciennes prophéties sont en train de s'accomplir. La transformation écologique s'accélère : l'eau, jadis plus coûteuse que l'or, coule à flots, et les jardins débordent sur le désert. Mais la prospérité nouvelle de Dune menace sa richesse, l'Epice de longévité et de prescience. Les durs Fremen, qui ont porté aux confins de l'univers humain la bannière et la parole de Muad'Dib, s'amollissent. Les vers géants se font rares. Et depuis que Paul est allé au désert pour y mourir selon la tradition Fremen parce qu'il a perdu la vue, ses prêtres ont construit sur son message de paix une théocratie autoritaire qui régit toute la galaxie. C'est alors que se jouent les destins des enfants de Dune. Leto et Ghanima, les jumeaux nés de Paul et de Chani, se sont éveillés à la conscience dans le ventre de leur mère et portent en eux les mémoires héréditaires d'innombrables générations. Il leur faut les dompter s'ils veulent échapper à l'Abomination redoutée par les Sœurs du Bene Gesserit à la possession par un spectre surgi de ce passé génétique. Il leur faut aussi déjouer les complots s'ils veulent survivre, refondre l'univers humain ébranlé par le Jihad et régner à leur tour sur Dune.