A Lyon, le jeune Serge, menacé, propose à l'abbé Glasberg une mission difficile : convaincre le ministère de la Marine de laisser embarquer, à Sète, 4.500 survivants des camps de la mort à bord du navire Exodus. Ce bateau doit conduire ses passagers en Palestine à l'insu de l'armée britannique, qui contrôle le pays et réprime les Juifs clandestins.