Énigmes principales : Deux pièces. Le premier amour. Le nouvel élève. Nom de code Cherry. Échec et Mat. Un nouvel élève fait son entrée dans la classe de Conan: Al Haibara. Il s’avère que non seulement elle connaît la véritable identité de Conan mais encore qu’elle faisait partie de l’organisation sous le nom de code «Cherry». Parce que sa sœur a été assassinée, elle trahit l’organisation et prend une dose d’apotoxine APTX 4869 qu’elle avait elle-même mis au point; elle voit alors, tout comme Conan, son corps rajeunir de 10 ans! Maintenant réunis, ils partent sans tarder à la recherche d’une disquette contenant toutes les données concernant l’APTX 4869: elle se trouverait chez M. Hirota, professeur à l’université mais... N’est-il pas déjà trop tard ? !