A New Cherbourg, en pleine Belle Epoque, les frères Côme et Pacôme Glacère enquêtent sur le vol d'un dossier top secret survenu au service de contre-espionnage de la ville. Ils sont aidés par leur nouvelle recrue Julienne et son jeune frère, Gus, marchand d'oiseau. Au même moment, une créature sous-marine inconnue est retrouvée sur la plage. L'enquête se déroule dès lors sur terre et sous la mer.

Sam, 11 ans, est en vacances d'été avec sa famille sur une ravissante île néerlandaise. Il décide de s'isoler quelques heures chaque jour pour s'habituer à vivre seul, mais sa rencontre avec l'intrépide Tess va bousculer son projet. La jeune fille a un secret et entraîne Sam dans sa mystérieuse mission. Cet été va changer leurs vies...