Mexique, début du XVIe siècle. Des mercenaires sanguinaires ayant envahi son village au petit matin, Jaguar Paw, un jeune chasseur Maya, parvient à mettre sa femme et son jeune fils à l'abri, avant d'être lui-même capturé. Tandis que celle-ci, enceinte, espère son retour depuis le fond d'un puits duquel elle ne peut sortir, Jaguar Paw, est escorté par ses ravisseurs jusqu'à une société décadente, qui calme la colère des Dieux en multipliant les sacrifices humains. Jaguar Paw parvient à s'enfuir à travers la jungle. Commence une chasse à l'homme sans merci.