Ganta Igarashi, collégien, est accusé à tort du massacre de toute sa classe. Condamné à mort, il est envoyé à Deadman Wonderland, une prison construite sur les ruines de Tokyo. Elle fait aussi office de parc d'attractions et propose à ses spectateurs des jeux dans lesquels les détenus s'entretuent. Ganta est rapidement dépassé par les événements, mais s'il trouve le courage d'avancer et de continuer à vivre c'est dans un but unique : se venger du véritable coupable, un mystérieux homme en rouge…