Kaito Kuroba, le héros de la série est issu de l'univers de Détective Conan. A la mort de son père, Kaito Kuroba se rend compte que ce dernier n'était pas seulement un magicien prestigieux, mais également le célèbre voleur Kaito Kid. Le jeune garçon enfile le costume de ce personnage insaisissable et se lance à la poursuite des assassins de son père.