Akili, 3 ans, un Pygmée né au Congo, est l'être humain le plus intelligent de la planète, capable de mettre au point des algorithmes plus rapidement que les ordinateurs les plus performants. J. Yeager, père d'un enfant atteint d'une maladie incurable, est envoyé par le président des Etats-Unis pour éliminer Akili, menace pour l'humanité, avant qu'il n'ait atteint son plein potentiel.