300 ans d’origine après notre ère, la Terre est désormais dominée par la toute puissance des esprits de la forêt qui infligent à l'humanité leur colère pour les souffrances passées. Dans ce nouveau monde, co-existent deux cités : Ragna, qui oeuvre pour le retour de la civilisation et la Cité Neutre qui prône l'harmonie avec la forêt. Le fragile équilibre qui régente cette Terre est à nouveau menacé lorsqu'Agito réveille par hasard une jeune fille du temps passé : Toola