Le paisible Rubis tente de gagner tous les concours de Hoenn avant son amie d'enfance, Saphir, qui suite à un pari souhaite relever le même défi, mais en moins de 80 jours. Leur compétition est interrompue par la Team Magma et la Team Aqua, qui ont pour projet d'étendre respectivement la terre et la mer.