1661, l'Assemblée du Clergé de France oblige tous les ecclésiastiques à signer un formulaire témoignant de leur soumission aux décisions du Saint-Siège. En 1664, l'Archevêque de Paris veut imposer cette décision aux religieuses de Port-Royal. Parmi elles, figure Soeur Angélique de Saint Jean, admirée par la toute jeune Soeur Françoise qui cherche auprès d'elle du réconfort. Parce qu'elle a décidé de se soumettre aux autorités religieuses et temporelle, Soeur Flavie a dénoncé les futures proscrites. Soeur Angélique décide alors de quitter le couvent et conclut : "La nuit passera et la vérité de Dieu demeurera éternellement, et délivrera tous ceux qui ne veulent être sauvés que par elle".